Ce que la variante Omicron pourrait signifier pour l’industrie des dispositifs médicaux
Les sociétés de diagnostic ont rapidement confirmé l’efficacité de leurs tests contre la nouvelle variante préoccupante, mais la technologie médicale est-elle préparée à davantage de perturbations liées au COVID-19 ?
Alors même que les systèmes hospitaliers du monde entier continuent de lutter contre la variante Delta du COVID-19, la variante Omicron du virus a suscité des inquiétudes dans le monde entier. L’Organisation mondiale de la santé (OMS) a qualifié Omicron de « variante préoccupante » à la fin de la semaine dernière.
L’OMS dit qu’il n’est toujours pas clair si Omicron se transmet plus facilement d’une personne à l’autre par rapport à d’autres variantes du virus qui cause le COVID-19. L’organisation a également déclaré qu’il n’était pas encore clair si l’infection par Omicron provoquait une maladie plus grave que les infections par d’autres variantes, y compris Delta. Les données préliminaires suggèrent qu’il y a une augmentation des taux d’hospitalisation en Afrique du Sud, a noté l’OMS, mais cela peut être dû à l’augmentation du nombre global de personnes infectées, plutôt qu’à une infection spécifique par Omicron.
Si la variante Omicron devient plus répandue dans le monde, cependant, nous pouvons être relativement sûrs que la chirurgie élective et les interventions chirurgicales « différables » prendront de nouveau le pas sur le COVID-19, en particulier dans des endroits comme les États-Unis où les hôpitaux sont confrontés à une main-d’œuvre importante. pénuries.
Les poussées de COVID-19 attribuées à la variante Delta, combinées aux pénuries de personnel hospitalier, se sont avérées être un double coup dur pour les bénéfices de plusieurs sociétés de dispositifs médicaux au troisième trimestre, dont Stryker. Alors que certains dirigeants de l’industrie ont parlé avec optimisme de la façon dont les hôpitaux s’améliorent pour jongler entre les cas de COVID-19 et les interventions chirurgicales, cet optimisme sera vraiment mis à l’épreuve si Omicron continue de se propager aussi rapidement qu’il l’a fait.
Les tests COVID-19 actuels toujours utiles pour détecter Omicron
Les entreprises de diagnostic qui développent des tests COVID-19, en revanche, continueront de bénéficier de la demande de tests. L’OMS a déclaré que les tests de réaction en chaîne par polymérase (PCR) largement utilisés pour le virus continuent de détecter l’infection, y compris l’infection par Omicron, comme ils l’ont fait avec d’autres variantes. L’organisation a déclaré que des études sont en cours pour déterminer s’il y a un impact sur d’autres types de tests COVID-19, y compris les tests de détection rapide des antigènes.
Les entreprises à la pointe des tests COVID-19 ont rapidement confirmé au cours du week-end que leurs tests actuels étaient capables de détecter la variante Omicron.
Abbott, qui fabrique actuellement plus de 100 millions de tests rapides et PCR COVID-19 chaque mois, a déclaré que la société avait déjà effectué une évaluation de la variante Omicron, et elle est convaincue que ses tests rapides et PCR peuvent détecter le virus.
« Bien que la variante Omicron contienne des mutations de la protéine de pointe, les tests rapides et moléculaires d’Abbott – antigène, PCR et NAAT – ne reposent pas sur le gène de pointe pour détecter le virus », a déclaré Abbott dans un communiqué. « Le processus d’évaluation des variantes et de test de résistance de nos tests ne s’arrête pas aux variantes actuelles. Nous collectons activement des échantillons du monde réel et utilisons des cultures virales pour vérifier que nos tests détectent en permanence les souches en circulation, car nous savons à quel point il est important que nos tests peuvent détecter de nouvelles variantes, quel que soit l’endroit où elles se trouvent. »
La société a déclaré que dès que la séquence Omicron était disponible, les scientifiques d’Abbott « ont travaillé sans arrêt » pour l’évaluer et ont déterminé que les mutations n’auraient pas d’impact sur la capacité des tests rapides et PCR d’Abbott à la détecter.
Thermo Fisher Scientific a confirmé lundi que son kit combiné PCR TaqPath COVID-19 et son kit TaqPath COVID-19 CE-IVD RT-PCR ne sont pas affectés par la variante émergente d’Omicron.
Thermo Fisher a déclaré que les tests TaqPath COVID-19 détectent les infections par le SRAS-CoV-2 en identifiant la présence de trois gènes cibles des régions orf1a/b, S et N du virus. En examinant plusieurs gènes, le test peut rapporter des résultats précis même dans le cas où l’une des cibles est affectée par une mutation, a expliqué la société. Alors que la cible du gène S dans le test est affectée en présence de mutations du variant Omicron, il a été déterminé que les cibles du gène orf1a/b et N dans les tests TaqPath COVID-19 n’étaient affectées par aucune des mutations du variant Omicron, sur la base de l’évaluation des séquences dans la base de données publique. En conséquence, la précision globale des tests TaqPath COVID-19 n’est pas affectée, a souligné la société.
La variante Omicron s’est avérée inclure la mutation 69-70del du gène S, identifiée pour la première fois comme une mutation dans la variante Alpha. Cette mutation provoque un abandon de la cible du gène S dans les résultats du test TaqPath, ce qui pourrait indiquer aux cliniciens et aux chercheurs une éventuelle infection par le variant Omicron. La confirmation doit ensuite être effectuée par séquençage de l’échantillon.
« Le test Thermo Fisher nous a permis de détecter les cas susceptibles de contenir le nouveau variant en identifiant les échantillons présentant un abandon du gène S », a déclaré Tulio de Oliveira, directeur du Center for Epidemic Response and Innovation, Stellenbosch University et UKZN, Afrique du Sud. « Cette identification précoce est très importante pour nous aider à suivre et à comprendre la propagation de la variante B.1.1.529 en Afrique du Sud et dans le monde. »
En plus des tests TaqPath COVID-19 originaux, Thermo Fisher a développé les tests TaqPath COVID-19 2.0 avec une conception de test avancée pour compenser les mutations émergentes. Les tests TaqPath COVID-19 2.0 sont conçus pour détecter la présence du SRAS-CoV-2 en utilisant huit cibles génétiques dans les régions orf1a/b et N du virus. Ces tests ont également été évalués par rapport aux séquences de la base de données publique et confirmés in silico pour détecter toutes les mutations B.1.1.529 sans perte de sensibilité.
« Comme tous les virus, nous avons toujours su que le SARS-CoV-2 continuerait de muter et que des stratégies de test efficaces sont essentielles pour freiner la pandémie », a déclaré Mark Stevenson, vice-président exécutif et directeur de l’exploitation chez Thermo Fisher Scientific. « C’est pourquoi nous avons développé des tests avec des contrôles et des équilibres intégrés supplémentaires, pour garantir que les cliniciens, les chercheurs et les responsables de la santé publique disposeraient d’outils efficaces pour tester avec précision le COVID-19 même si la constitution génétique du virus évoluait. »
Des tests de génotypage spécifiques pour détecter la variante Omicron sont en cours de développement pour le panel de mutation TaqMan de Thermo Fisher. Le panel, qui est actuellement utilisé à des fins de recherche, dispose déjà d’un menu de plus de 50 tests pour évaluer les cas confirmés de COVID-19 pour la présence de variantes et de mutations connues.
